元順帝還有另一個別名，叫做元惠宗。元順帝是明朝史料的叫法，元惠宗是元朝史籍的叫法，為什么會出現這樣的差別呢？那是因為妥懽帖睦爾是主動退走的，這種做法被明朝的大臣認作是順應天命的做法，因此多以元順帝稱呼妥懽帖睦爾。而在蒙古各部，妥懽帖睦爾則稱為元惠宗。

元順帝登基之后，燕鐵木兒一黨發動叛亂，這場叛亂一直到1335年才得以平定。

元順帝雖然登基為皇，但是在他在位的前期時間里，日子過的并不是很好。登基之后，燕鐵木兒的兒子唐其勢發動叛亂，叛亂到了兩年后才得以平定。雖然平定了叛亂，但是朝堂上還有權臣把持朝政。

元順帝朝時，右丞相伯顏勢大，朝政權利大半都掌握在他的手中。當時伯顏的權勢大到什么地步呢？他可以完全不考慮元順帝的想法，可以實行自己想實行的政策，而不用看皇帝臉色。不說看皇帝臉色，甚至很多時候還會甩臉色給元順帝看。

伯顏把持朝政期間，采取排擠南人的政策，禁止南人參政，取消科舉，不允許漢人學習蒙古語，加深了蒙古族和漢族的矛盾。元順帝雖然打心眼里反對伯顏的政策，但是迫于伯顏的權勢，只能任由其發展。

隨著皇帝與伯顏矛盾的逐漸加深，元順帝終于在伯顏之侄脫脫的堅決支持下，力排眾議，成功地廢黜了伯顏，并控制了政局。此后伯顏的許多政策才被元順帝廢止，還恢復了科舉。廢黜伯顏之后，元順帝改立脫脫為右丞相，并命其主持修撰遼史、金史、宋史三史。

元順帝時期是一個很壞的年代，這個時期天災頻發，物價上漲，人民生活痛苦不堪，使得早在元文宗時期就已經頻繁發生的民變，到了他這兒直接變成農民起義，其中最為著名的便是公元1351年的紅巾軍起義。這場起義的源頭，在于元順帝一朝濫發貨幣，導致通貨膨脹。黃河水災頻發，元順帝下令讓右丞相脫脫遏黃河回故道以整治水患，因此加重了當時的徭役。繁重的徭役就像是壓死駱駝的稻草，讓本來就在生死存亡邊緣徘徊的民眾，不堪重負下爆發起義。

起義爆發之初，元朝雖然獲得了一定的勝利，但是起義軍像是雨后竹筍一般，源源不斷的冒出來，各地農民和紛紛揭竿起義，起義軍勢力越來越龐大，朝廷內部又發生皇帝和皇太子兩派之間的明爭暗斗，使得順帝朝局再也無法得到有效控制。

就這樣，各地起義軍不斷發展壯大，元朝軍隊節節敗退，各省紛紛落入起義政權手中。公元1368年，由朱元璋建立的大明政權，讓大將徐達率軍進攻大都，元順帝向北撤離至上都，隨著局勢的發展又撤離至吟唱，雖然期間組織過元軍的反撲，但是毫無作用。就這樣，元順帝最終在當初蒙古帝國發家的地方，郁郁病逝。