1866年，海上出現了一個行動敏捷的“龐然大物”，人們認為它是一條獨角鯨，一個學富五車的科學家阿龍納斯教授要把它除掉，最后，知道了這條獨角鯨是一艘鸚鵡螺號的潛水艇，這艘潛水艇上的船長尼摩是一位國籍不明的人，他把阿龍納斯教授、阿龍納斯教授的伙伴尼德·蘭和阿龍納斯教授的仆人康塞爾一起囚禁了起來，沒讓他們離開潛水艇。

之后，他們一起周游了太平洋、印度洋、紅海、地中海、大西洋以及南極和北冰洋，遇見了許多罕見海底動植物，還發現了海底洞穴、暗道和遺址等等。尼摩船長心地十分善良，看到朋友死去會無聲地落淚；會把上百萬黃金送給窮苦的人；會收容所有厭惡陸地的人；會把滿口袋的珍珠送給可憐的采珠人。有一次，在南極缺氧的時候，潛水服的儲蓄罐里只剩下一絲空氣了，但是尼摩船長并沒有吸最后的空氣來維持生命，而是把空氣給了阿龍納斯教授，他為了別人而犧牲了自己，他的壯舉讓我頓時淚流滿面，心生感動和震撼！

有一次，阿龍納斯教授和尼摩船長去采珠，他們在途中看到了許多稀有的珍珠，尼摩船長帶著阿龍納斯教授去了一個海底巖洞，里面有一個非常大的珍珠，這顆珍珠是尼摩船長自己養的，阿龍納斯非常佩服尼摩船長。

還有一次，阿龍納斯教授和他的伙伴們看見了一個巨型海馬，他們到了小艇上，尼德·蘭猛地用魚叉叉那只海馬，海馬掙扎了一番就死了。回到船上，阿龍納斯教授還和他們一起吃了一頓海馬肉呢！